وی دارای دیپلم تدوین فیلم از مدرسه عالی سینما و تلویزیون است و فعالیت هنری‌اش را با ساخت فیلم‌های کوتاه آغاز کرد.

افخمی پس از ساخت چند فیلم مستند در تلویزیون، فعالیت در سینمای حرفه‌ای را با فیلم «زیر باران» به کارگردانی سیف الله داد به عنوان مدیر فیلمبرداری آغاز کرد.

در سال 1367 و در پی انصراف ناصر تقوایی از ساخت مجموعه تلویزیونی «کوچک جنگلی» کارگردانی آن را به عهده گرفت.

وی با کارگردانی فیلم عروس دیپلم افتخار بهترین کارگردانی را از نهمین جشنواره فیلم فجر دریافت کرد.

از دیگر فعالیت‌های جنبی وی می‌توان به تدریس سینما، عضویت در شورای هنرستان روایت فتح و نماینده مردم در ششمین دوره مجلس شورای اسلامی اشاره کرد.

مرجان شیرمحمدی؛ بازیگر سینما و نویسنده، همسر بهروز افخمی است.

برخی از آثار سینمایی بهروز افخمی:

    این خانه من نیست (۱۳۸۹)
    سن پترزبورگ (۱۳۸۸)
    عملیات ۱۲۵ (۱۳۸۸)
    فرزند صبح (۱۳۸۷-۱۳۸۴)
    گاوخونی (۱۳۸۱)
    شوکران (۱۳۷۷)
    جهان پهلوان تختی (۱۳۷۶)
    عقرب (۱۳۷۵)
    روز شیطان (۱۳۷۳)
    روز فرشته (۱۳۷۲)
    عروس (۱۳۶۹)
    تفنگ‌های سحرگاه (۱۳۶۷)
    سریال کوچک جنگلی (۱۳۶۶)